Rok 1944. Sierżant Robert Savage dowodzi oddziałem komandosów, wysłanym z tajną misją do Berlina. Zdradzeni żołnierze zostają zmasakrowani, a Savage trafia do niewoli. Naziści przeprowadzają na nim eksperyment, którego celem jest stworzenie doskonałego wojownika. Mija 50 lat. Uśpionego sierżanta odnajduje i przywraca do życia elitarna jednostka G.I Joe. Obdarzony wielkimi, choć niestabilnymi mocami Savage staje na czele oddziału Screaming Eagles.