Kontynuacja komedii pt. "Czarodzieje z Waverly Place: Film". Tym razem rodzina Russo wybiera się do Włoch, by spotkać się z krewnymi. Kiedy Alex Russo (Selena Gomez) demonstruje umiejętności magiczne, wyczarowuje przypadkiem swoje dwa sobowtóry, Mroczną Alex i Dobrą Alex. Pierwsza z nich postanawia przejąć władzę nad światem, druga zaś pragnie uratować mieszkańców. Wkrótce na szczycie Krzywej Wieży w Pizie dochodzi do starcia między nimi dwiema.

Rodzina Russo wraz z przyjaciółmi wyrusza do Toskanii, aby spotkać się ze swoimi zaginionymi krewnymi... Alex próbuje udowodnić, że nie jest tylko młodą, beztroską czarodziejką, i nieumyślnie rzuca zaklęcie, które powołuje do życia Dobrą Alex i Złą Alex. 
Gdy Zła Alex sprzymierza się z młodym, ujmującym czarodziejem, który pragnie przejąć kontrolę nad światem, Dobra Alex musi znaleźć sposób na ocalenie swojej rodziny i całej ludzkości. Ostatecznie obie osobowości naszej bohaterki muszą się zmierzyć w wielkiej bitwie na szczycie Krzywej Wieży w Pizie.