Żeński klasztor. Grupa zakonnic prowadzona przez zasadniczą Matkę Przełożoną próbuje chronić się przez grzesznym, zepsutym światem. Wkrótce na czele kobiet staje charyzmatyczny ksiądz Franciszek, który otworzy przed nimi nowe pojęcie Boga. Przeorysza razem z duchownym głosić będą prawdę, według której nie tylko duch, ale też ciało winno doświadczać Najwyższego... Niedługo potem wokół klasztoru pojawia się kolczasty drut, nikt już nie może wejść do środka, ani wyjść na zewnątrz. To, co dzieje się za murem pozostaje tajemnicą sióstr i księdza Franciszka. Tylko jedna z nich, Anna, wydaje się nie być do końca przekonana, co do nowej formy wyznawania wiary. Osamotniona, wewnętrznie rozdarta, będzie musiała stoczyć bezwzględną walką o czystość swojej duszy i ... ciała...

"W imieniu diabła" to kobiecy film zaangażowany w dyskusję na temat śmierci Boga. Obraz rozgrywa się w żeńskim klasztorze, świat przedstawiony jest podporządkowany katolickiej moralności, wiara narzuca jasną perspektywę postrzegania rzeczywistości. Kategorie szaleństwa i normalności, dobra i zła są rzekomo wyraźnie rozgraniczone, dusza jest oddzielona od grzechów ciała dzięki jego umundurowaniu. Nie ma tu znaczenia, czy mamy na myśli habit czy żołnierską kurtkę - reżyserka dokonuje między nimi zbyt wyraźnego porównania.