Dwadzieścia lat po fiasku, jakim okazał się projekt Elysion, który zrujnował Ziemię, pewna dziewczyna, Cesarzowa, budzi się ze snu w podziemnym laboratorium badawczym. Nie pamiętając nic ze swojej przeszłości, Cesarzowa spotyka Norito i Miyę, razem z ...