Cierpiąca na zanik pamięci Ellis zostaje obciążona winą za zamordowanie słynnego fizyka Heinricha Schneidera. Ukrywającą się dziewczynę odnajduje w meksykańskiej wiosce łowczyni głów Nadie. Jednak zamiast ją wydać, Nadie decyduje się pomóc Ellis. Obie wyruszają bez wahania w drogę na południe. Przy pomocy tajemniczego kamienia o nazwie "Róża Inków" i niepewnych wspomnień Ellis dziewczęta szukają zaginionego miasta Winay Marka, by wyjaśnić przeszłość Ellis. Niebawem wychodzi na jaw, że dziewczyna dysponuje dziwną telepatyczną mocą...
Serial El Cazador de la bruja to zamknięcie trylogii "Girls-with-Guns" reżysera Koichi Mashimo. Opowieść ta łączy urok Noir ze szczyptą Thelma & Louise i włoskiego westernu. Muzyka Yuki Kajiury nastrojowo podkreśla atmosferę tego serialu.

Ellis zamordowała podobno sławnego fizyka Heinricha Schneidera. Ona sama cierpi jednak na amnezję i nic nie pamięta. Teraz musi uciekać, bo wyznaczono nagrodę za jej głowę. Szuka jej między innymi niejaka Nadie. Kiedy Nadie odkrywa Ellis w pewnej meksykańskiej wiosce, decyduje się nie wydać jej, ale jej pomóc. Rozpoczyna się ich wspólna podróż w poszukiwaniu tajemniczego miasta o nazwie Winay Marka. Na ich drodze pomoże im magiczny kamień "Inka Rose" i mgliste wspomnienia Ellis. Wygląda też na to, że dziewczyna dysponuje siłami nadprzyrodzonymi...