Oparta na najpopularniejszym serialu animowanym ostatnich miesięcy na Cartoon Network, "Generator Rex: Agent of Providence" pozwala graczowi przejąć kontrolę nad głównym bohaterem Rexem. Rex jest nastolatkiem który posiada możliwość wpływania na kształt swojego ciała dzięki „nanitom”, co pozwala mu na stworzenie dowolnej broni! W grze, Rex ściga się z czasem by powstrzymać złego Van Kleissa i jego armię przed zniszczeniem świata!

Przeciwnicy Rexa, znani jako E.V.O które są także zarażone „nanitami”, ale w przeciwieństwie do Rexa - nanity doprowadziły do mutacji swoich nosicieli w potworne bestie, zagrażają całemu światu i ludzkości. Organizacja Providence została stworzona do walki z tymi właśnie stworzeniami. Dzięki pomocy Rexa i Providence, gracze będą walczyć w najdalszych zakątkach dżungli, nieprzyjaznych pustyniach i w ogromnych metropoliach by powstrzymać zagrożenie! W miarę przechodzenia gry Rex będzie miał możliwość tworzenia bardziej zaawansowanych broni przeciwko E.V.O.