"Kryzys Kubański" to połączenie strategii czasu rzeczywistego z globalną strategią taktyczną, rozgrywaną w trybie turowym. Gra przedstawia konflikt militarno-polityczny pomiędzy USA i ZSRR w roku 1962. Jest to alternatywna interpretacja słynnych wydarzeń na Kubie, według której napięcia na linii Moskwa-Waszyngton doprowadziły jednak do zbrojnego konfliktu.
W wyniku kryzysu dwa światowe supermocarstwa skorzystały z broni atomowej, zamieniając większość świata (w tym i Kubę) w radioaktywną pustynię. Ci, którzy zdołali przeżyć ataki zrozumieli, że najważniejszym surowcem na świecie jest czysta, nieskażona woda. Mieszkańcy Ziemi przygotowują się do kolejnego, krwawego konfliktu - walki o przetrwanie.