Gracz wciela się w Davida Forestera, młodego podchorążego z Akademii Gwiezdnej Floty. Przechodzi tam przez rozbudowany system szkoleń, który wykorzystuje różne scenariusze symulatora misji i korzysta z kilku klas statków. Możemy także wchodzić w interakcje z kadetami na terenie kampusu. Spotkamy się również z kapitanem Sulu i komandorem Chekovem oraz z kapitanem Kirkiem, który będzie przydzielał nam zadania.