"Syphon Filter: Logan's Shadow" to przedstawiona z perspektywy trzeciej osoby gra akcji. Jest to też drugi tytuł o przygodach Gabe'a Logana, wykonana z myślą o konsoli PlayStation Portable.

Główny bohater, Gabe Logan, jest agentem tajnej organizacji wywiadowczej Stanów Zjednoczonych, zajmującej się infiltracją podejrzanych kompleksów i likwidacją zagrożeń terrorystycznych. Ty razem jego zadnie polega na przejęciu supernowoczesnej broni, znajdującej się na pokładzie U.S.S. Mount S. Helena płynącego po Oceanie Indyjskim. Na miejscu okazuje się, że towar został skradziony a po statku biegają uzbrojeni po zęby terroryści. Cała historia obfituje w wiele interesujących szczegółów i nagłych zwrotów akcji. 
W grze ujrzymy mnóstwo nowości, włączając w to nowe uzbrojenie czy sposoby walki. Do tych pierwszych dorzucono rakietnice, kilka rodzajów granatów i min. W tej odsłonie serii walka wręcz będzie bardziej zaawansowana. Możliwe na przykład będzie złapanie oponenta i wykorzystanie jego ciała jako żywej tarczy. Powiększeniu uległ także ekwipunek Gabe'a, mówiąc ściślej – dodano harpun, dzięki któremu Logan może bronić się przed przeciwnikami podczas misji wykonywanych pod powierzchnią wody. Arsenał Logana składa się z pistoletów, broni snajperskiej i karabinów szturmowych.