"System Shock" to przygodowa gra akcji utrzymana w konwencji sci-fi. Jej wydarzenia mają miejsce w 2072 roku na pokładzie stacji kosmicznej Citadel, należącej do korporacji TriOptimum. Wcielamy się w jednego z członków jej załogi - hakera ze wszczepionym pół roku wcześniej neuroimplantem. Został on wynajęty do wyłączenia komputera pokładowego posiadającego sztuczną inteligencję, tzw. Shodan. Kiedy nasz bohater budzi się ze śpiączki pooperacyjnej, dokonuje szokującego odkrycia. Okazuje się bowiem, że Shodan przejęła całkowitą kontrolę nad Citadel i wymordowała prawie wszystkich jej pracowników. Jedyna szansa na przeżycie w tej sytuacji to unicestwienie głównego komputera stacji.