Dla postaci Koraliny zaprojektowano aż 28 kukiełek o różnych rozmiarach. Główna lalka miała 24 cm wzrostu.
W scenie zanim Koralina odkrywa ukryte w ścianie drzwi, dziewczynka upuszcza swój notatnik i w tym samym momencie widać jak przedmiot ten jest podtrzymywany za pomocą sznurków.
Kiedy Drugi Ojciec zaczyna grać na fortepianie, rękawice instrumentu same nakładają się na jego dłonie kiedy spogląda na Koralinę ale gdy odwraca się z powrotem do pianina, rękawiczki zamieniają się rękami.
Kiedy Koralina gości u swoich drugich rodziców po raz pierwszy na kolacji na stole stoi pusty kieliszek oraz szklanka pełna wody. W następnym ujęciu widać, że szklanka jest pełna tylko w połowie, a w kolejnym naczynie jest już kompletnie puste.
Film powstawał w Portland (Oregon, USA).
"Koralina i tajemnicze drzwi" jest pierwszym filmem w historii kina łączącym animację poklatkową z technologią 3-D.
MCC Theater z Nowego Jorku stworzył musical "Koralina" z muzyką i tekstami Stephina Merritta z zespołu The Magnetic Fields.
Na tyle furgonetki można zobaczyć napis "StopMo Rulz". StopMo to skrót od "Stop-Motion", cały napis można więc przetłumaczyć jako "animacja poklatkowa rządzi".
Dziesięć osób musiało pracować 3-4 miesiące, by stworzyć jedną kukiełkę Koraliny. Takich kukiełek było łącznie 28.
Na jednodolarowym banknocie, który matka Koraliny daje jako napiwek, widnieje podobizna Henry'ego Selicka, reżysera filmu.
Film trwa godzinę i czterdzieści minut, co czyni go najdłuższym filmem zrobionym w technice poklatkowej.
W pewnym momencie filmu Koralina pokazuje 16 różnych wyrazów twarzy w ciągu 35 sekund.
Zespół They Might Be Giants napisał na potrzeby filmu 10 piosenek, ale z powodu zmiany nastroju produkcji filmu z czysto musicalowej na bardziej mroczną, wszystkie utwory zostały wycięte prócz jednego: w scenie, w której drugi ojciec Koraliny gra na pianinie i śpiewa piosenkę głosem Johna Linnella. Zespół stwierdził, że utwory skomponowane dla filmu uwzględni przy swoich innych projektach i wyda w postaci albumów.
Prace nad filmem rozpoczęły się 22 maja 2006 roku.