Kimihiro Watanuki ma dość poważny problem - podążają za nim dziwne istoty, które tylko on może zobaczyć. W trakcie ucieczek przed jedną z nich trafia do wnętrza budynku, który okazuje się być sklepem "spełniania życzeń". Bohater prosi więc o to by w końcu te istoty zniknęły i mógł prowadzić normalne życie. Okazuje się, że na spełnienie tego życzenia musi zapracować jako pomocnik w owym sklepie...