"Submarine Titans" to strategia czasu rzeczywistego, której akcja toczy się w przyszłości. W 2047 roku kometa uderzyła w ziemię powodując kataklizm i sprawiając, że na powierzchni nie było już warunków do życia. Ocalała część ludzkości schroniła się pod powierzchnią mórz i oceanów. Ludzie podzielili się na dwie zwalczające się frakcje (Białe Rekiny i Czarne Ośmiornice), a wkrótce do konfliktu dołącza także obca rasa Silikonów, która przybyła na ziemię wraz kometą. Gracz ma możliwość gry każdą spośród trzech frakcji w trzech kampaniach złożonych z kilkunastu misji. Zadaniem gracza jest rozbudowa baz, produkcja jednostek bojowych, prowadzenie badań naukowych oraz walka z pozostałymi frakcjami. Rozgrywkę uatrakcyjniają takie elementy jak pięć różnych poziomów zanurzenia jednostek, czy w pełni konfigurowalna sztuczna inteligencja. Akcja przedstawiona jest w dwuwymiarowej grafice, ale w przeciwieństwie do wielu innych gier tego typu kąt kamery można zmieniać, a widok przybliżać i oddalać.